Buongiorno,
se da un punto di vista meccanico gli unici problemi possono riguardare qualche spessore o distanza differente dei supporti o delle guarnizioni, nel caso in cui la Yamaha non ha apportato nessuna modifica "esterna" del motore, non avrai alcun problema.
Da un punto di vista legale, invece, dovresti avere l'attenzione di conservare il documento che attesti il precedente proprietario ed il relativo passaggio di proprietà del motore in quanto, anche se è quasi impossibile che ad un posto di blocco ti vadano a controllare il numero del motore (cosa che invece può avvenire per quello del telaio), potrebbe emergere che sei in possesso di un motore rubato o che risulta rottamato...