Il filtro era "standard" o "race"?
Il terminale mantiene le stesse caratteristiche dell'originale, oppure è uno scarico racing omologato (con DB killer)?
Nelle seconde ipotesi, hai fatto riprogrammare la centralina o, meglio, hai montato un Power Commander, vero?
Per tornare alla condizione base, hai rimontato anche lo scarico originale, giusto?
P.S.
Dai sintomi, potrebbe trattarsi di un guasto di questo coso qui:

...ma non ho la competenza necessaria da assicurartelo.
"Io cerco le curve anche nei rettilinei" Tonino Guerra